赵奇，男，工学博士，硕士生导师，iHealth团队主要成员；2017年于吉林大学计算机科学与技术学院获得计算机科学与技术（生物信息学）专业工学博士学位，2014~2015年在中国人民解放军空军军医大学联合培养，2015~2016年在密苏里大学联合培养；现为东北大学医学与生物信息工程学院专任教师；研究方向为人工智能、深度学习在生物信息和生物医学工程中的应用、计算结构生物学、生物医学大数据挖掘；作为负责人主持国家自然科学基金青年基金1项、中央高校基本科研业务专项资金1项、辽宁省科技厅项目1项、东北大学基本科研业务基金1项、校企合作项目1项；参与东北大学创新团队项目1项、国家自然基金面上项目1项、吉林省科技厅面上项目2项；在国内外高水平学术期刊杂志上发表论文20余篇。

个人主页： 

http://faculty.neu.edu.cn/zhaoqi/zh_CN/index.htm（不常用）

招生信息：

l招收专业：计算机类、人工智能类、生物信息学、生物医学工程、生命科学类等专业的硕士研究生，良好掌握程序设计技术，了解深度学习模型或算法设计方法

l希望你：对新事物有好奇心，对科研有热情，能够坚守初心，有理想有追求，不甘心做一名普通的程序员

l未来就业方向：IT互联网大厂算法岗、智能设备/医疗设备设计制造工程师、生物信息分析师、科研院校研究员、攻读博士研究生等

联系方式： 

l地址：东北大学浑南校区生命楼B座B524室iHealth IoT Research Lab

l邮箱：zhaoqi@mail.neu.edu.cn

l电话、微信：188-4256-3710

研究方向：  

l人工智能和算法在生物信息、生物医学工程中的应用：各类深度学习模型和算法设计方法

l可信人工智能：深度学习模型的攻击与防御

l计算结构生物学：RNA结构预测、解析和设计

l生物医学数据挖掘：医学影像分析、医学信号分析、电子病历数据挖掘、生物信息数据挖掘

课程信息：

l本科生：算法设计与分析、生物信息学

l研究生：人工智能在生物和医学中的应用

代表性项目： 

l国家自然科学基金青年基金1项

l中央高校基本科研业务专项资金1项

l辽宁省科技厅项目1项

l东北大学创新团队项目1项

l东北大学基本科研业务基金1项

l校企合作项目1项

l国家自然基金面上项目1项

l吉林省科技厅面上项目2项

代表性论文：

lLi W.#, Zhao Q.#, Qian M., Effect of modifying pumpkin preparation on oral processing of breads, Journal of Texture Studies, 2024 (JCR 二区)

lZhao Z., Wan J., Wang Y., Li B., Zhao Q.*, ALM: Adaptive Local Mimic for Edge Microservice, 2024 (会议论文)

lZhao, Z.; Fan, X.; Xie, X.; Mao, Q.; Zhao, Q. AP-SDN: Action Program enabled Software-Defined Networking Architecture. KSII Transactions on Internet and Information Systems 2023 (JCR二区)

lZhao, Q., Liu, F., Song, Y., Fan, X., Wang, Y., Yao, Y., Mao, Q., Zhao, Z. Predicting Respiratory Rate from Electrocardiogram and Photoplethysmogram Using a Transformer-Based Model. Bioengineering, 2023 (JCR二区)

lLiu, W., Du, S., Pang, N., Zhang, L., Sun, G., Xiao, H., Zhao, Q., Xu, L., Yao, Y.; Alastruey, J.; et al. Central Aortic Blood Pressure Waveform Estimation with a Temporal Convolutional Network. IEEE J Biomed Health Inform 2023 (JCR 一区)

lSun, L., He, Q., Teng, Y., Zhao, Q., Yan, X., Wang, X. A Complex Network-Based Vaccination Strategy for Infectious Diseases. Applied Soft Computing, 2023, (JCR一区)

lZhao Q., Zhao Z., Fan X., et al. RNA independent fragment partition method based on deep learning for RNA secondary structure prediction., 2023 (JCR一区)

lZhao Q., Zhao Z., Fan X., et al. Review of machine learning methods for RNA secondary structure prediction[J]. PLoS Comput. Biol., 2021, 17(8): e1009291. （JCR一区）

lHuang J.#, Zhao Q.#, Wei X., et al. miR-351-3p promotes rat amniotic fluid-derived mesenchymal stromal cell proliferation via targeting the coding sequence of Abca4[J]. Stem Cells, 2021, 39(9): 1192-1206. （JCR一区）

lZhao Q., Mao Q., Zhao Z., et al. Prediction of plant-derived xenomiRs from plant miRNA sequences using random forest and one-dimensional convolutional neural network models[J]. BMC Genomics, 2018, 19(1): 839. （JCR一区）

lZhao Q., Liu Y., Zhang N., et al. Evidence for plant-derived xenomiRs based on a large-scale analysis of public small RNA sequencing data from human samples[J]. PLoS One, 2018, 13(6): e0187519. （JCR二区）

lZhao Q, Mao Q, Yuan W, et al. RNA-par: An RNA Exterior Loop Predicting Model for RNA Secondary Structure Prediction[J]. 2022.

lLiu Y.*, Zhao Q.,Zhang H., et al. A New Method to Predict RNA Secondary Structure Based on RNA Folding Simulation[J]. IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform., 2016, 13(5): 990-995. （JCR一区）

lZhao, Q., Liu, Y., Duan, Y., Dai, T., Xu, R., Guo, H., & Zhang, H. (2017). FledFold: a novel software for RNA secondary structure prediction. Letters in organic chemistry, 14(9), 714-716. （SCI）

lZhao, Q., Zhang, C., & Zhao, Z. (2017). A decoy chain deployment method based on SDN and NFV against penetration attack. PloS one, 12(12): e0189095. （SCI）

lZhao, Q., Zhang, C., & Zhao, Z. (2017). SCM: A method to improve network service layout efficiency with network evolution. PloS one, 12(12): e0189336. （SCI）

lWang, H., Fang, Z., Liu, L., Xu, P., & Zhao, Q. (2012). The Improved File Caching Mechanism Based on Aging Algorithm. In Advances in Information Technology and Industry Applications (pp. 531-538). Springer, Berlin, Heidelberg.

lTang, M., Lv, Q., Lu, Z., Zhao, Q., & Song, Y. (2012, August). Dynamic virtual switch protocol using Openflow. In 2012 13th ACIS International Conference on Software Engineering, Artificial Intelligence, Networking and Parallel/Distributed Computing (pp. 603-608). IEEE.

lZhang, C., Fang, Z., Zhuang, L., & Zhao, Q. (2012). The Hypothesized Server Environment Based on VMware Construction. Lecture Notes in Information Technology, 19, 158.

lMulti-class seizure classification from EEG signals based on spatial-temporal-spectral attention (2024 投稿中)

lBackdoor Attacks on Self-Supervised Learning: A survey (2024 投稿中)

lTemporal Graph Representation Network for outcome and length of stay prediction in ICU (2024 投稿中)

lQSM：A Quick Shuffle Method to Defense LDoS Attack in Microservice System (2023 投稿中)

lDTS: A Dynamic Cleaning Method for Link Flooding Attack Traffic Based on Programmable Data Planes (2024 投稿中)

lAP-EH_An Encryption Hopping method based on Action Program enabled SDN (2024 投稿中)

lSDEmu-Net_Fetal Ultrasound Standard Plane Identification Based on a Sonographer-Diagnosis-Emulation and Spatio-Temporal Attention Module (2024 投稿中)

lReview of Masticatory Simulator Based on Oral Physiology (2024 投稿中)

lRelationships of Image Texture Properties with Chewing Activity and Mechanical Properties during Mastication of Bread (2024 投稿中)

代表性专利：

l一种基于动作可编程软件定义网络的加密跳变方法

l一种数据平面动作可编程的软件定义网络系统

l一种链路泛洪攻击流量动态清洗系统及方法

l一种术中脊柱图像的识别方法（审查阶段）

l基层社会网格治理下社会网络中负面信息影响力最小化算法（审查阶段）

l基层社会网格治理下社会网络用户的信任影响力最大化算法（审查阶段）

l一种仿生舌驱动装置（审查阶段）

l一种仿生咀嚼装置（审查阶段）

l一种姜汁-马铃薯淀粉生物复合膜及其制备方法（审查阶段）

l一种基于复合神经网络的呼吸频率预测方法 （审查阶段）

教材：

l《可信机器学习》

l《离散数学基于Python语言的实现》

软件：

l基于可编程数据平面的DDOS攻击流量动态清洗系统

liHealth RNA序列划分RNA-par软件

lTransRR呼吸频率预测软件